Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms