Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncbp1Q3UYV9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncbp1Q3UYV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms