Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prom2Q3UUY6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prom2Q3UUY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms