Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prrc1Q3UPH1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms