Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms