Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tmem253Q3UNB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem253Q3UNB8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms