Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cog7Q3UM29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms