Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg7Q3ULF4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms