Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcgf5Q3UK78 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcgf5Q3UK78 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcgf5Q3UK78 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcgf5Q3UK78 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcgf5Q3UK78 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms