Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc61Q3UJV1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms