Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm648Q3UJ22 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms