Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hdhd2Q3UGR5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hdhd2Q3UGR5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms