Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Carmil3Q3UFQ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Carmil3Q3UFQ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms