Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yipf3Q3UDR8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms