Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms