Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U6N9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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