Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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