Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc136Q3TVA9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc136Q3TVA9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms