Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms