Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms