Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2f1Q3THK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms