Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RubcnlQ3TD16 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms