Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccbe1Q3MI99 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms