Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vax1Q2NKI2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vax1Q2NKI2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms