Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms