Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms