Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam171bQ14CH0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms