Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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Tdrd9Q14BI7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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Tdrd9Q14BI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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Tdrd9Q14BI7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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Tdrd9Q14BI7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd9Q14BI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd9Q14BI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms