Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms