Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd2Q149F1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpusd2Q149F1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpusd2Q149F1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms