Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spatc1Q148B6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Spatc1Q148B6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Spatc1Q148B6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spatc1Q148B6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spatc1Q148B6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Spatc1Q148B6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms