Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 TFC1YBR123C 1950 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 FRE4YNR060W 2160 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 MSM1YGR171C 1728 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YPP1YGR198W 2454 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YHR078WYHR078W 1659 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 TEC1YBR083W 1461 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YDR250CYDR250C 276 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 RRT13YER066W 558 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 SDP1YIL113W 630 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YIR014WYIR014W 729 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 AIM25YJR100C 984 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 CYC2YOR037W 1101 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 MCA1YOR197W 1299 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YPL276WYPL276W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YBR089WYBR089W 600 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 SNQ2YDR011W 4506 nt2.74□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 HBT1YDL223C 3141 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 TCB2YNL087W 3537 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 RPS29BYDL061C 171 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 ARC15YIL062C 465 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 MRPL49YJL096W 486 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YKL177WYKL177W 339 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 SEC14YMR079W 915 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 RLP7YNL002C 969 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 TUM1YOR251C 915 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 CNS1YBR155W 1158 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 BPT1YLL015W 4680 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 PUS9YDL036C 1389 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YIG1YPL201C 1386 nt2.73□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 DOA4YDR069C 2781 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 KTR6YPL053C 1341 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 SEC15YGL233W 2733 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YCR007CYCR007C 720 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 VBA4YDR119W 2307 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 JIP3YLR331C 378 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YLR416CYLR416C 399 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 ALG8YOR067C 1734 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 VPS33YLR396C 2076 nt2.72□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 GIS4YML006C 2325 nt2.71□□□□□ -1.97
PEX11Q12462 YPL150WYPL150W 2706 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 RPN1YHR027C 2982 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 NMA111YNL123W 2994 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 TDA3YHR009C 1572 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 CEP3YMR168C 1827 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 BET1YIL004C 429 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YJR020WYJR020W 333 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 IME1YJR094C 1083 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 PHD1YKL043W 1101 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 PBA1YLR199C 831 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YAR069CYAR069C 294 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 USV1YPL230W 1176 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 NDC80YIL144W 2076 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 TPD3YAL016W 1908 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 CHS3YBR023C 3498 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YAT2YER024W 2772 nt2.71□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 UBP14YBR058C 2346 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 MAL12YGR292W 1755 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 SLP1YOR154W 1764 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 MAL32YBR299W 1755 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 DNA2YHR164C 4569 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YDL162CYDL162C 357 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 SED5YLR026C 1023 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 ATG13YPR185W 2217 nt2.7□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 SRO9YCL037C 1305 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 DBP5YOR046C 1449 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 snR70snR70 164 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 BUD30YDL151C 582 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YIL025CYIL025C 375 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 CDA2YLR308W 939 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 PPA2YMR267W 933 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 SSN8YNL025C 972 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YOL079WYOL079W 399 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 MDV1YJL112W 2145 nt2.69□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YPR148CYPR148C 1308 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 MEF1YLR069C 2286 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YGR237CYGR237C 2358 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YDR442WYDR442W 393 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 RMT2YDR465C 1239 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 KXD1YGL079W 657 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YGR273CYGR273C 525 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 TAF14YPL129W 735 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YBR096WYBR096W 693 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 FAR1YJL157C 2493 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 BUB1YGR188C 3066 nt2.68□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YGR067CYGR067C 2415 nt2.67□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 GRX3YDR098C 858 nt2.67□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 SPT2YER161C 1002 nt2.67□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 RNR2YJL026W 1200 nt2.67□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 HHF2YNL030W 312 nt2.67□□□□□ -1.98
PEX11Q12462 YBL065WYBL065W 345 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms