Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rundc1Q0VDN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms