Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zc3h18Q0P678 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zc3h18Q0P678 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms