Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SctQ08535 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SctQ08535 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SctQ08535 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SctQ08535 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SctQ08535 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SctQ08535 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SctQ08535 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SctQ08535 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SctQ08535 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SctQ08535 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SctQ08535 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SctQ08535 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms