Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calb2Q08331 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms