Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CbfbQ08024 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms