Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NrepQ07475 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms