Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms