Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CluQ06890 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CluQ06890 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms