Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Aplp2Q06335 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Aplp2Q06335 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aplp2Q06335 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aplp2Q06335 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms