Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r236Q05A06 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r236Q05A06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms