Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dcst1Q059Y8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dcst1Q059Y8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms