Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms