Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms