Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crisp3Q03402 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crisp3Q03402 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms