Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Msx2Q03358 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms