Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col6a2Q02788 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms