Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ascl1Q02067 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms