Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col1a2Q01149 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col1a2Q01149 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col1a2Q01149 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col1a2Q01149 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms